neuroConstruct 1.6.0

Lesen: Percuma ‎Saiz fail: 50.00 MB
‎Penarafan Pengguna: 3.5/5 - ‎2 ‎Undi

Tentang neuroConstruct

neuroConstruct sedang dibangunkan di Makmal Perak di Jabatan Neurosains, Fisiologi dan Farmakologi di UCL. neuroConstruct telah direka untuk memudahkan pembangunan rangkaian kompleks neuron biologi yang realistik, iaitu model yang menggabungkan morfologi dendritik dan perlakuan membran sel realistik. Ia dilaksanakan di Jawa dan menjana fail skrip untuk simulator NEURON dan GENESIS, dengan sokongan untuk platform simulasi lain (termasuk PSICS, MOOSE dan PyNN) pada peringkat pembangunan lanjutan. Ia menggunakan spesifikasi NeuroML terkini, termasuk MorphML, ChannelML dan NetworkML. Pembangunan perisian ini telah dibuat dengan pembiayaan dari Wellcome Trust, Majlis Penyelidikan Perubatan dan Projek Synapse EU. Beberapa ciri utama neuroConstruct adalah: * neuroConstruct boleh mengimport fail morfologi dalam GENESIS, NEURON, Neurolucida, SWC dan MorphML format untuk dimasukkan dalam sel tunggal atau model rangkaian, atau lebih sel abstrak juga boleh dibina secara manual. * Penciptaan rangkaian neuron berasaskan perlakuan yang diletakkan dalam 3D * Corak kesambungan kompleks antara kumpulan sel boleh ditentukan untuk rangkaian * Skrip simulasi boleh dijana untuk simulator berasaskan NEURON, GENESIS, MOOSE, PSICS dan PyNN (nota: tidak setiap projek boleh dijana untuk setiap simulator) * Mekanisme selular biophysically realistik (sipap / mekanisme saluran) boleh diimport dari fail skrip asli (*.mod atau *.g) atau dicipta daripada templat menggunakan ChannelML * Penjanaan kod secara automatik untuk merekodkan data simulasi dan visualisasi / analisis data dalam neuroConstruct * Larian simulasi yang direkodkan boleh dilihat dan diuruskan melalui antara muka Pelayar Simulasi * Antara muka skrip berasaskan Python boleh digunakan untuk mengawal penjanaan dan pelaksanaan model, membolehkan beberapa simulasi dijalankan untuk pengoptimuman model sel dan rangkaian